Anne Kupczok

Christian-Albrechts-Universität zu Kiel (CAU)
Institut für Allgemeine Mikrobiologie

Projekte

Mein wissenschaftliches Interesse liegt in der Genomevolution von Mikroben, insbesondere wie Phagen und fremde DNA Elemente die Genomevolution beeinflussen. Bakterien und Archaeen haben eine Abwehr gegen fremde Elemente wie Phagen, Plasmide und andere DNA, die in die Zelle eindringt, aber sie schaffen auch ein Gleichgewicht zwischen der Abwehr und den positiven Effekten von horizontalem Gentransfer. In diesem Zusammenhang beschäftige ich mich mit dem adaptiven Immunsystem von Bakterien und Archaeen, das verschiedene Elemente sequenz-speziefisch unterscheiden kann. Die Wechselwirkung zwischen Mikroben und Phagen hat eine Auswirkung auf die Genomevolution, Diversifikation und Populationsstruktur und ist damit auch für ökologische Zusammenhänge von Interesse.
Weiterhin bin ich in Kollaborationen mit Experimentalsten involviert, wo ich zu Bioinformatikanalysen beitragen kann, insbesondere zu genomischen und phylogenetischen Analysen und zur Auswertung von Next-Generation-Sequencing-Daten.